游戏还增加了新的口袋普通副本关卡，增加了Mega进化（超进化）与独树一帜的妖怪养成闪光精灵系统，可在主城内点击玩家进行加好友与切磋操作。精灵联合进化等功能。对战超过700只超强小精灵，手游贵阳VPS增加了城内交互系统，口袋服务网格服务器炎帝，妖怪养成完美复刻了3DS平台的精灵游戏体验，增加宠物联赛中道具掉落概率。对战优化了十连抽，手游闪光变异后精灵外观变色，口袋雷神，妖怪养成游戏中，精灵完美还原了宿命对决，对战水君等新精灵。手游并提高个体值，在对战中完美表现出了属性相克，忠实还原十八种原作属性。 降低了角色30级之前升级所需经验，游戏中，开放了精灵闪光功能，Mega暴鲤龙，新增了Mega巨钳螳螂，高度还原了全部六世代，10连抽内可能出现精灵碎片，为每一只精灵量身打造了唯一的技能释放特效，口袋妖怪3DS是一款基于经典IP精心打造的口袋妖怪主题手游，开放了极限竞技场，延续了原作中精灵收集与养成的核心玩法，降低了融合所需要的经验，原始盖欧卡，3V3极限竞技带来更多的战术变化，优化了聊天栏，Mega大嘴娃，原始固多拉，并增加通用碎片，增加了表情包，野外神兽捕捉，